Diversidad y potencial biotecnológico del Dominio Archaca en Cuatro Ciénegas, Coahuila

En este trabajo describimos la diversidad de Archaea en un estanque poco profundo en el Valle de Cuatro Ciénegas (VCC) al noreste de México, con condiciones hipersalinas fluctuantes que contienen esteras microbianas elásticas que pueden formar pequeños domos donde su interior anóxico nos recuerda las características del Eón Arqueano, rico en gases de metano y azufre; así, llamamos a este sitio los Domos del Arqueano (DA). Estos domos solo se forman después de fuertes lluvias que son raras en el desierto de Chihuahuense. El VCC es un oasis único con cientos de pozas que contiene especies endémicas de animales, plantas y comunidades microbianas muy diversas y únicas, a pesar de su estequiometria muy sesgada, debido principalmente al contenido extremadamente bajo de fósforo (suelos, columnas de agua y sedimentos). Esta oligotrofia extrema ha favorecido la supervivencia de microorganismos ancestrales. En este proyecto, se realizó un enfoque de secuenciación de metagenomas completos para este sitio inusual en tres estaciones diferentes, así como un enfoque dependiente de cultivo, en el cual se lograron aislar y describir 4 cultivos arqueanos para evaluar la extensión de la biodiversidad de Archaea, ya que los miembros de este Dominio han estado sub-representados en diferentes sitios de estudio dentro del oasis. Encontramos una comunidad Arqueana muy diversa que abarca ~ 5% de los metagenomas. En los tres metagenomas la comunidad arqueana mantuvo su abundancia y la mayoría de las cepas mostraron formar un núcleo resistente durante tres muestreos estacionales (2016- 2017), a pesar de las fluctuaciones ambientales. Sin embargo, las abundancias relativas de las 230 OTU arqueanas (usando un cutoff de 97%) fueron lo suficientemente bajas (<0.1%) para ser consideradas parte de la biosfera rara. El hallazgo de AD y su descripción dentro de CCB confirma que este sitio en particular es el más diverso para el Dominio Archaea que conocemos y abre nuevos caminos para comprender las fuerzas que una vez impulsaron y siguen formando el ensamblaje de la comunidad microbiana

Evolution towards pathogenicity: Comparative analysis between Brucella and a recently isolated Pseudochrobactrum

Póster presentado Online en el XXVIII Congreso Nacional de Microbiología 28 de junio al 2 de julio, 2021 .- https://hal.inrae.fr/hal-03337244/documentLa brucelosis es una de las zoonosis bacterianas más ampliamente distribuidas en el mundo, contribuyendo de forma importante a la pobreza de muchos países en desarrollo. Ninguna de las vacunas actuales proporciona una protección completa, son virulentas para humanos e interfieren en el diagnóstico serológico. Por ello, para mejorar las vacunas actuales, es imprescindible seguirestudiando los mecanismos de virulencia de Brucella, el agente etiológico de la brucelosis. Ésta pertenece a las α-2 Proteobacteria, grupo que incluye desde bacterias ambientales hasta bacterias que han evolucionado a patógenos animales difícilmente detectados por el sistema inmune, como es el caso de Brucella. Para estudiar la evolución que se ha dado hacia la patogenicidad en esta familia y poder determinar mejor así los factores de virulencia de Brucella, es interesante comparar bacterias filogenéticamente próximas que son biológicamente diferentes. Por primera vez, se han aislado bacterias del género Pseudochrobactrum en un huésped natural de Brucella.Pseudochrobactrum es un género filogenéticamente cercano a Brucella que, hasta la fecha, sólo incluye bacterias ambientales. En este trabajo se han caracterizado estos nuevos aislamientos y teniendo en cuenta sus propiedades fisiológicas, su perfil de lípidos polares y ácidos grasos, y el análisis filogenético, se ha propuesto una nueva especie con el nombre de Pseudochrobactrum bovis. Los estudios comparativos con Brucella han revelado diferencias en la composición de la envoltura celular, el contenido genético y virulencia. Por ello, P. bovis puede representar un nuevo modelo para estudiar la evolución de Brucella hacia la virulenciaN

Diseño de circuitos genéticos para la traducción de reacciones químicas en fenotipos seleccionables (Trampas Genéticas), basados en la interacción entre reguladores transcripcionales y sus moléculas efectoras

Tesis doctoral inédita. Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de lectura: 06-11-200